Identifikasi Molekuler Cerek Jawa (Charadrius javanicus)

Yuda, Ign. Pramana Identifikasi Molekuler Cerek Jawa (Charadrius javanicus). [Research]

Text (Penelitian Teknobiologi) BL48104.pdf Restricted to Registered users only Download (2MB)

Abstract

Penelitian ini bertujuan utuk mengidentifikasi Cerek jawa (Charadrius javanicus) secara molekuler dan mengetahui perbedaan keragaman genetiknya dengan kelompok superspesies Cerek tilil (C. alexandrius). Analisis molekuler yang digunakan berbasis PCR dengan dua marka DNA mitrokondrial, yaitu D-Loop dan ND3. Sampel darah Cerek jawa dikoleksi dari Pantai Trisik, Yogyakarta (10), Wonorejo, Surabaya (1) dan Indramyu (1). Tidak semua sampel teramplifikasi dengan kedua marka tersebut. Tida sampel tidak teamplifikasi dengan D_Loop dan dua tsampel tidak teramplifikasi dengan ND3. Hasil reaksi sekuennya dari sampel yang teramplifikasi mengindikasikan bahwa masih perlu dilakukan optimasi PCR. Berdasarkan pencaraian kemiripan hasil sekuen yang baik (masing-masing 2 sampel dengan D-Loop dan ND3) dalam database NCBI, sekuen DNA Cerek jawa hasil penelitian ini merupakan haplotipe baru yang tidak ada di database. Sekuen DNA Cerek jawa, baik berdasarkan D-Loop dan ND3 memiliki kemiripan dengan sekuen Cerek tilil

Actions (login required)

View Item