EFEKTIVITAS EMPAT PASANG PRIMER UNTUK IDENTIFIKASI JENIS KELAMIN SECARA MOLEKULER PADA PASSERIFORMES

., Krisdianti (2018) EFEKTIVITAS EMPAT PASANG PRIMER UNTUK IDENTIFIKASI JENIS KELAMIN SECARA MOLEKULER PADA PASSERIFORMES. S1 thesis, UAJY.

Text (Krisdianti) BL01458.pdf Restricted to Repository staff only Download (3MB)

Abstract

Passeriformes merupakan ordo yang memiliki tingkat keanekaragaman tertinggi yaitu mencapai 59%(kurang lebih 5.300 sp) dari burung di dunia. Penentuan jenis kelamin pada ordo Passeriformes cukup sulit dilakukan karena kurang lebih 60% dari ordo ini merupakan monomorfik berdasarkan warna bulunya. Tujuan penelitian ini untuk menentukan jenis kelamin pada individu dari 11 spesies yang termasuk dalam Passeriformes dan membandingkan efektivitas yang dimiliki oleh 4 pasang primer dalam proses ampilifikasi PCR. Primer yang digunakan yaitu P2/P8, 1237L/1272H, 2550F/2718R dan 2561/2728, yang mengamplifikasi gen Chromo-helicase-DNA (CHD). Jumlah sampel yang digunakan sebanyak 21 individu. Berdasarkan penelitian yang telah dilakukan, didapatkan hasil yaitu keempat pasang primer secara positif mampu mengamplifikasi CHD dengan individu betina sebanyak 10 dan jantan sebanyak 11 individu. Primer P2/P8, 2550F/2718R dan 2561 mampu mengmplifikasi 100% sedan gkan 1237L/1272H 90,84%. Evaluasi efektivitas primer dilakukan dengan menghitung jumlah pita yang terbentuk dari amplikon dan mengukur panjang basa.Efektivitas primer P2/P8 dan 1237L/1272H 52,38% dan 47,62%. Kondisi yang sama primer 2550F/2718R dan 2561/2728 memiliki efektivitas yang lebih tinggi yaitu 90,84% dan 100%. Penentuan jenis kelamin molekuler dapat mengidentifikasi jenis kelamin pada burung ordo Passeriformes di Indonesia serta didapatkan sekuens gen CHDW dan CHDZ dari Cynirris jugularis dan Dicrurus leucopaheusdengankomposisi A+T pada CHDWyaitu 64,13% dan 65,93%, sedan gkan pada CHDZ yaitu 62,29% dan 61,44%.

Actions (login required)

View Item